1949年春，国民党军主力已被歼灭，国民党当局一面策划撤逃台湾，一面在华东、中南、西南和西北等地区作“应变部署”：预留大批特务和党政军骨干分子，妄图推行所谓“游击计划”，建立“大陆游击根据地”，等待时机配合台湾国民党军队反攻大陆。
1949年夏秋，上述四地区的匪势已开始形成。他们占据着各省的结合部、偏僻山区和沿海岛屿，疯狂进行危害人民、颠覆新生政权的破坏活动。因此，从1949年5月到1953年底，人民解放军在继续完成解放全中国任务的同时，遵照中共中央和中央军委的战略部署，相继在华东、中南、西南和西北的新解放区，进行了大规模的剿匪斗争。各剿匪部队在广大人民群众的支援下，经过长期艰苦奋战，共歼灭土匪和武装特务260多万人，谱写了新中国剿匪斗争的光辉篇章。
据统计，1949年底，东南沿海地区仅陆上就有土匪11.3万多人，其中山东省有3000余人，江苏约有8600人，浙江有4.7万人，福建有4万多。
他们开办“游击干部研究班”，培训土匪特务武装的领导骨干；将原来的军管区、师管区、团管区及保安旅取消，分别编为潜伏的“游击总队”或“支队”；积极网罗旧官僚、恶霸地主、反动军官和反动会道门成员，有计划地组织匪特武装；与此同时，大批残兵散卒和形形色色的地主武装、地痞流氓也或聚集为匪，或转化为匪。他们多则数千人、少则几十人，互相勾结，形成一股股猖獗的反动势力。
1949年春，当人民解放军准备横渡长江之时，国民党当局为延长其反动统治，阻止我大军南进，有计划、有组织地建立所谓“敌后第二战线”，其“国防部”拟订了“敌后游击计划大纲”，并针对不同地区作了不同部署。因此，当我人民解放军渡过长江，进军福建后，从胶东半岛到闽南的东南沿海地区，匪乱暴起，匪患成灾。他们占山为王，夺岛为窝，陆匪、海匪相互配合，十分猖獗。